当胡萝卜种植过程中出现分叉现象时，很多人会以为是胡萝卜种子的问题。实际上，即使我们想培育出分叉胡萝卜那也是很困难的，所谓导致胡萝卜分叉的原因实际上还是下扎过程中的意外条件所致，大致分为四种原因：

首先是胚根发育的问题，如果胚根发育不良，母体种子营养条件不好，培根瘦弱或天生畸形，这样的种子萌发后的根容易发生分叉现象。

再就是物理伤害，胡萝卜扎根过程中遇到的地下害虫和土壤中的碎石硬物会伤及胡萝卜根尖细胞导致根部分叉，持续生长，就形成了分叉根。

第三个原因是化学伤害，地里的肥料浓度过高时会有腐蚀作用，此外除草剂、化肥残留物都是造成胡萝卜根部分叉的隐患，所以，在施肥和喷洒杀虫除草药物时要严格控制浓度，做到均匀适度。

造成胡萝卜分叉的第四个原因是短硼症，硼元素对胡萝卜生长起着致关重要的作用，作用在于稳定根尖细胞的分化程度，在缺乏硼元素的土壤中，胡萝卜根很容易在高位发生分化，从而就成为了分叉根。